平成29年5月24日現在
 会長 郡 健二郎（名古屋市立大学長） |
 副会長 柴田 洋三郎（福岡県立大学長） |
 副会長 荒川 哲男（大阪市立大学長） |
 副会長 鬼頭 宏（静岡県立大学長） |
| 専務理事 | 奥野 武俊 | 前大阪府立大学長 |
| 地区選出理事 | ||
| （北海道・東北地区） | 塚本 泰司 | 札幌医科大学長 |
| （関東・甲信越地区） | 上野 淳 | 首都大学東京学長 |
| （東海・北陸地区） | 稲垣 隆司 | 岐阜薬科大学長 |
| （近畿地区） | 廣川 能嗣 | 滋賀県立大学長 |
| （中国・四国地区） | 川波 洋一 | 下関市立大学長 |
| （九州・沖縄地区） | 半藤 英明 | 熊本県立大学長 |
| 指名理事 | 清水 一彦 | 山梨県立大学長 |
| 〃 | 辻 洋 | 大阪府立大学長 |
| 〃 | 村嶋 幸代 | 大分県立看護科学大学長 |
| 監事 | 片桐 恭弘 | 公立はこだて未来大学長 |
| 〃 | 上泉 和子 | 青森県立保健大学長 |
公立大学改革支援・評価研究センター
| センター長 | 浅田 尚紀 | 兵庫県立大学副学長（前広島市立大学長） |
公立大学協会事務局
| 事務局長 | 中田 晃 |